辣椒在生长的时候，我们总是想尽办法来提高产量；但是有的辣椒生长缓慢，僵而不发；还有的落花落果严重，这些现象就是我们常说的生理障碍，原因主要是肥料管理的失误。
肥料因素大棚辣椒定植之前，施用了过多的氮素肥料，氮素的分解使土壤酸化。尿素过量易分解产生二氧化氮气体，当浓度达2~3毫克/升时，辣椒即会遭受为害。
施用过量的生物有机复合肥，有的农户每亩施用氮、磷、钾含量为25%的生物有机复合肥100公斤以上，土壤溶液浓度过大会发生反渗透现象，烧根后引起辣椒叶片蔫萎。
施用了尚未腐熟的有机肥料，也易产生有毒气体。
春夏露地栽培的辣椒，追施高浓度的水粪，也会导致辣椒烧根，轻者落花落果，重者全株枯死。
土壤缺乏某些营养元素，使辣椒“缺绿”、“失绿”，使之植株营养器官变形。
整体营养状况较差时多形成中柱花，营养差时多形成短柱花，不能自花授粉而落花。
水分因素阴雨天栽苗，土温低、土壤板结，辣椒幼苗容易僵老。
当土壤水分不足，空气干燥时，易使辣椒叶柄弯曲，叶片下垂。
平畦栽培，雨后渍水难排，土壤通气不良，根系进行无氧吸收，有毒物质积累过多，天气乍晴辣椒大片死苗。
辣椒坐果之前灌水：降低土温，造成陡长，推迟挂果时间，降低产量。
水肥管理措施抢晴栽苗。农谚说“宁可一日迟，不可一日湿”。意思就是要抢取晴天移栽辣椒苗，可避免土壤板结、僵苗，有利于根土吻合，缩短缓苗期，快速恢复生长。同时，移栽大田要做到厢窄沟深，或者高畦栽培，以利排水。
适期浇水。除移栽定苗时浇足辣椒定根水外，幼苗返青至开花前一般不再浇水。连续干旱时只需轻度浇水。当幼果长到3厘米左右长时，如遇干旱，可沟灌，进行湿润管理，切忌大水漫灌，以防倒苗。
合理配施肥料。辣椒对肥料十分敏感，既喜肥又怕肥。
做到有机肥与无机肥相配合，有机肥一定要腐熟。提倡施用生物有机复合肥，或者高能复合肥。
因土因苗酌情施用氮肥，特别是不能施用过量的尿素。
既施氮、磷、钾等大量元素，也要配施钙、镁、铁、硼、锌、钼等中量及微量元素，防止出现失绿、缺绿症或异形果。
避过高温，用腐熟的低浓度的清水粪追肥。进入结果期，可视苗情，每隔10~15天，施用清水粪或复合肥追肥提苗。